Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MALSU1Q96EH3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MALSU1Q96EH3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms