Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP4Q96DX8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTP4Q96DX8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms