Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLCD1Q96CP7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLCD1Q96CP7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms