Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX9

MIB2, E3 ubiquitin-protein ligase MIB2, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2Q96AX9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MIB2Q96AX9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIB2Q96AX9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIB2Q96AX9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms