Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX1

VPS33A, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33AQ96AX1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS33AQ96AX1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS33AQ96AX1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS33AQ96AX1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms