Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB7BQ96AH8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms