Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATA6Q92908 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms