Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIFAP3Q92845 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIFAP3Q92845 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIFAP3Q92845 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIFAP3Q92845 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KIFAP3Q92845 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIFAP3Q92845 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIFAP3Q92845 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KIFAP3Q92845 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms