Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CTTNBP2Q8WZ74 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CTTNBP2Q8WZ74 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CTTNBP2Q8WZ74 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CTTNBP2Q8WZ74 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms