Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRUNE2Q8WUY3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRUNE2Q8WUY3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRUNE2Q8WUY3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRUNE2Q8WUY3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRUNE2Q8WUY3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRUNE2Q8WUY3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms