Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHACTR4Q8IZ21 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHACTR4Q8IZ21 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHACTR4Q8IZ21 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHACTR4Q8IZ21 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR4Q8IZ21 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms