Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCGF5Q86SE9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms