Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ZFYVE16Q7Z3T8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZFYVE16Q7Z3T8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ZFYVE16Q7Z3T8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZFYVE16Q7Z3T8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms