Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP34Q70CQ2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP34Q70CQ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms