Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBR3Q6ZT12 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBR3Q6ZT12 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBR3Q6ZT12 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
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