Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN12

MCTP2, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP2Q6DN12 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP2Q6DN12 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP2Q6DN12 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP2Q6DN12 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCTP2Q6DN12 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCTP2Q6DN12 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCTP2Q6DN12 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCTP2Q6DN12 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCTP2Q6DN12 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP2Q6DN12 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP2Q6DN12 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms