Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LGALS9CQ6DKI2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LGALS9CQ6DKI2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms