Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SUSD4Q5VX71 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SUSD4Q5VX71 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SUSD4Q5VX71 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SUSD4Q5VX71 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms