Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN9Q5TKA1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms