Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PXDC1Q5TGL8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PXDC1Q5TGL8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms