Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRTP1Q5TC63 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms