Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0F5

VPS26B, Vacuolar protein sorting-associated protein 26B, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26BQ4G0F5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS26BQ4G0F5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26BQ4G0F5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms