Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL38Q2WGJ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms