Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRNQ16849 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRNQ16849 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
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