Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIK5Q16478 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIK5Q16478 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIK5Q16478 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
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