Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP13Q15645 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIP13Q15645 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIP13Q15645 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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