Protein–RNA interactions for Protein: Q15005

SPCS2, Signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2Q15005 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPCS2Q15005 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPCS2Q15005 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms