Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIDRQ14159 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIDRQ14159 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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