Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP1A4Q13733 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP1A4Q13733 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A4Q13733 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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