Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR1H3Q13133 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1H3Q13133 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1H3Q13133 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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