Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 LRP12-204ENST00000519675 5008 ntTSL 28.54□□□□□ -1.043e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.063e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.13e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.163e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.23e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NOL8-228ENST00000545444 2090 ntTSL 57.44□□□□□ -1.223e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.33e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 FBXL17-202ENST00000481160 604 ntTSL 36.7□□□□□ -1.343e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.353e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NOL8-202ENST00000360868 4341 ntTSL 26.2□□□□□ -1.423e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.483e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NOL8-217ENST00000536593 4053 ntTSL 1 (best)5.61□□□□□ -1.513e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.593e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NOL8-207ENST00000434228 3400 ntTSL 24.94□□□□□ -1.623e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NOL8-227ENST00000544867 4598 ntTSL 1 (best)4.91□□□□□ -1.623e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.713e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.723e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.743e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.813e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 KIF21A-214ENST00000636569 6157 ntTSL 53.65□□□□□ -1.833e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 POLG-216ENST00000636530 100 ntTSL 52.5□□□□□ -2.013e-9■■■■■ 33
FMR1Q06787 MCM2-208ENST00000480910 693 ntTSL 228.94■■■□□ 2.221e-11■■■■■ 32.9
FMR1Q06787 MCM2-204ENST00000472731 547 ntTSL 217.88■□□□□ 0.451e-11■■■■■ 32.9
FMR1Q06787 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 32.9
FMR1Q06787 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.055e-8■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.675e-8■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.165e-8■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 REST-209ENST00000622863 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.785e-8■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.155e-8■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 HEPH-205ENST00000429547 569 ntTSL 413.13□□□□□ -0.317e-13■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 HEPH-204ENST00000425114 2459 ntTSL 511.8□□□□□ -0.527e-13■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 HEPH-207ENST00000458621 838 ntTSL 211.3□□□□□ -0.67e-13■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 SNX5-206ENST00000469704 696 ntTSL 333.44■■■□□ 2.946e-21■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.996e-21■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 SNX5-203ENST00000419004 778 ntTSL 520.62■□□□□ 0.896e-21■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 SNX5-204ENST00000431277 840 ntTSL 519.89■□□□□ 0.776e-21■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 SNX5-214ENST00000490175 2025 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.516e-21■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.426e-21■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 OVOL2-204ENST00000486776 550 ntTSL 317.35■□□□□ 0.376e-21■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 SNX5-207ENST00000474883 695 ntTSL 56.86□□□□□ -1.316e-21■■■■■ 32.8
FMR1Q06787 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 32.7
FMR1Q06787 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 32.7
FMR1Q06787 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 32.7
FMR1Q06787 PRRC2A-203ENST00000460302 697 ntTSL 314.56□□□□□ -0.086e-8■■■■■ 32.7
FMR1Q06787 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 32.6
FMR1Q06787 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 32.6
FMR1Q06787 CAD-207ENST00000475695 687 ntTSL 321.63■■□□□ 1.052e-8■■■■■ 32.6
FMR1Q06787 MCM2-202ENST00000468414 1076 ntTSL 215.22■□□□□ 0.033e-9■■■■■ 32.6
FMR1Q06787 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 32.6
FMR1Q06787 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.297e-7■■■■■ 32.6
FMR1Q06787 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 32.6
FMR1Q06787 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 32.6
FMR1Q06787 SPTBN2-211ENST00000617502 3498 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 32.6
FMR1Q06787 PRPF8-209ENST00000573725 749 ntTSL 57.84□□□□□ -1.158e-8■■■■■ 32.6
FMR1Q06787 PRPF8-202ENST00000571346 865 ntTSL 217.36■□□□□ 0.375e-9■■■■■ 32.5
FMR1Q06787 FRYL-203ENST00000502520 441 ntTSL 223.68■■□□□ 1.384e-6■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 FRYL-219ENST00000515684 465 ntTSL 322.41■■□□□ 1.184e-6■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 FRYL-218ENST00000514783 2031 ntTSL 1 (best)18.16■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 CLUH-208ENST00000574166 585 ntTSL 418.1■□□□□ 0.499e-8■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 59.31□□□□□ -0.924e-8■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 LMBR1-218ENST00000486837 576 ntTSL 28.47□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 LMBR1-215ENST00000461603 612 ntTSL 47.62□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 FRYL-212ENST00000509886 692 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.234e-6■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.344e-6■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 FRYL-207ENST00000505437 443 ntTSL 35.11□□□□□ -1.594e-6■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 LMBR1-212ENST00000448926 3629 ntTSL 24.8□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 RANBP2-205ENST00000629728 156 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 CSNK2A2-205ENST00000566813 1569 ntTSL 511.76□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 CSNK2A2-206ENST00000567730 947 ntTSL 311.26□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 526.83■■□□□ 1.892e-8■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 SRPK2-211ENST00000482862 329 ntTSL 526.47■■□□□ 1.832e-8■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 SRPK2-206ENST00000465112 568 ntTSL 318.06■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 SRPK2-203ENST00000460391 666 ntTSL 217.4■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 SRPK2-204ENST00000462282 505 ntTSL 315.25■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 SMS-204ENST00000478094 488 ntTSL 416.07■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 32.4
FMR1Q06787 PRPF8-207ENST00000573681 1044 ntTSL 214.37□□□□□ -0.115e-11■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 MAPRE2-213ENST00000591734 803 ntTSL 228.92■■■□□ 2.222e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 ICAM5-204ENST00000587398 624 ntTSL 223.91■■□□□ 1.422e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.42e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 SLC4A1AP-205ENST00000613517 819 ntTSL 521.46■■□□□ 1.032e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 MAPRE2-205ENST00000585592 622 ntTSL 213.77□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 MAPRE2-209ENST00000588910 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 SLC4A1AP-204ENST00000613058 2966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 MAPRE2-204ENST00000538170 4093 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 SLC4A1AP-201ENST00000326019 2959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 SLF2-203ENST00000370271 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 SP1-201ENST00000327443 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 SLF2-201ENST00000238961 7288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 MAPRE2-208ENST00000588349 543 ntTSL 58.2□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 32.3
FMR1Q06787 IDH1-209ENST00000484575 1044 ntTSL 28.09□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 32.3
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 53.1 ms