RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480910.1

MCM2-208, Transcript of minichromosome maintenance complex component 2, human

TSL 2

Gene MCM2, Length 693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MCM2-208	ENST00000480910	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.54	■■■■■ 6.64
MCM2-208	ENST00000480910	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.23	■■■■■ 5.63
MCM2-208	ENST00000480910	ABCC9	O60706	1549 aa		49.56	■■■■■ 5.52
MCM2-208	ENST00000480910	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.45	■■■■■ 5.19
MCM2-208	ENST00000480910	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.42	■■■■■ 5.18
MCM2-208	ENST00000480910	NACAD	O15069	1562 aa		47.36	■■■■■ 5.17
MCM2-208	ENST00000480910	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.02	■■■■■ 5.12
MCM2-208	ENST00000480910	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47	■■■■■ 5.11
MCM2-208	ENST00000480910	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.71	■■■■■ 5.07
MCM2-208	ENST00000480910	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.36	■■■■■ 5.01
MCM2-208	ENST00000480910	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.35	■■■■■ 5.01
MCM2-208	ENST00000480910	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.13	■■■■■ 4.97
MCM2-208	ENST00000480910	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.9	■■■■■ 4.94
MCM2-208	ENST00000480910	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		45.88	■■■■■ 4.94
MCM2-208	ENST00000480910	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.48	■■■■■ 4.87
MCM2-208	ENST00000480910	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.88	■■■■■ 4.78
MCM2-208	ENST00000480910	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.76	■■■■■ 4.76
MCM2-208	ENST00000480910	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.53	■■■■■ 4.72
MCM2-208	ENST00000480910	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.88	■■■■■ 4.61
MCM2-208	ENST00000480910	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.78	■■■■■ 4.6
MCM2-208	ENST00000480910	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.77	■■■■■ 4.6
MCM2-208	ENST00000480910	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.77	■■■■■ 4.6
MCM2-208	ENST00000480910	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.61	■■■■■ 4.57
MCM2-208	ENST00000480910	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.61	■■■■■ 4.57
MCM2-208	ENST00000480910	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.45	■■■■■ 4.55
MCM2-208	ENST00000480910	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.45	■■■■■ 4.55
MCM2-208	ENST00000480910	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.33	■■■■■ 4.53
MCM2-208	ENST00000480910	WIZ	O95785	1651 aa		43.08	■■■■■ 4.49
MCM2-208	ENST00000480910	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	43.04	■■■■■ 4.48
MCM2-208	ENST00000480910	NES	P48681	1621 aa		42.84	■■■■■ 4.45
MCM2-208	ENST00000480910	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MCM2-208	ENST00000480910	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
MCM2-208	ENST00000480910	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.56	■■■■■ 4.4
MCM2-208	ENST00000480910	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.51	■■■■■ 4.4
MCM2-208	ENST00000480910	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.34	■■■■■ 4.37
MCM2-208	ENST00000480910	CUX2	O14529	1486 aa		42.3	■■■■■ 4.36
MCM2-208	ENST00000480910	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.19	■■■■■ 4.34
MCM2-208	ENST00000480910	CFTR	P13569	1480 aa		42.18	■■■■■ 4.34
MCM2-208	ENST00000480910	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.16	■■■■■ 4.34
MCM2-208	ENST00000480910	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
MCM2-208	ENST00000480910	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.98	■■■■■ 4.31
MCM2-208	ENST00000480910	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.92	■■■■■ 4.3
MCM2-208	ENST00000480910	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.91	■■■■■ 4.3
MCM2-208	ENST00000480910	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.79	■■■■■ 4.28
MCM2-208	ENST00000480910	WDR62	O43379	1518 aa		41.78	■■■■■ 4.28
MCM2-208	ENST00000480910	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.64	■■■■■ 4.26
MCM2-208	ENST00000480910	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.61	■■■■■ 4.25
MCM2-208	ENST00000480910	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.43	■■■■■ 4.22
MCM2-208	ENST00000480910	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.28	■■■■■ 4.2
MCM2-208	ENST00000480910	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.2	■■■■■ 4.19
MCM2-208	ENST00000480910	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.16	■■■■■ 4.18
MCM2-208	ENST00000480910	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.06	■■■■■ 4.16
MCM2-208	ENST00000480910	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.98	■■■■■ 4.15
MCM2-208	ENST00000480910	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.93	■■■■■ 4.14
MCM2-208	ENST00000480910	CUX1	P39880	1505 aa		40.9	■■■■■ 4.14
MCM2-208	ENST00000480910	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.83	■■■■■ 4.13
MCM2-208	ENST00000480910	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.81	■■■■■ 4.12
MCM2-208	ENST00000480910	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.78	■■■■■ 4.12
MCM2-208	ENST00000480910	SOGA1	O94964	1423 aa		40.78	■■■■■ 4.12
MCM2-208	ENST00000480910	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.72	■■■■■ 4.11	6e-6	■■■■□ 25.1
MCM2-208	ENST00000480910	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.69	■■■■■ 4.1
MCM2-208	ENST00000480910	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
MCM2-208	ENST00000480910	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.59	■■■■■ 4.09
MCM2-208	ENST00000480910	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.53	■■■■■ 4.08
MCM2-208	ENST00000480910	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.44	■■■■■ 4.06
MCM2-208	ENST00000480910	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MCM2-208	ENST00000480910	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.39	■■■■■ 4.06
MCM2-208	ENST00000480910	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.38	■■■■■ 4.06
MCM2-208	ENST00000480910	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.37	■■■■■ 4.05
MCM2-208	ENST00000480910	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.28	■■■■■ 4.04
MCM2-208	ENST00000480910	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.28	■■■■■ 4.04
MCM2-208	ENST00000480910	FBLN2	P98095	1184 aa		40.27	■■■■■ 4.04
MCM2-208	ENST00000480910	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.26	■■■■■ 4.04
MCM2-208	ENST00000480910	CHD1	O14646	1710 aa		40.19	■■■■■ 4.02
MCM2-208	ENST00000480910	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.19	■■■■■ 4.02
MCM2-208	ENST00000480910	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
MCM2-208	ENST00000480910	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.1	■■■■■ 4.01
MCM2-208	ENST00000480910	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.08	■■■■■ 4.01
MCM2-208	ENST00000480910	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.05	■■■■■ 4
MCM2-208	ENST00000480910	TRIM41	Q8WV44	630 aa		39.94	■■■■□ 3.98
MCM2-208	ENST00000480910	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		39.89	■■■■□ 3.98
MCM2-208	ENST00000480910	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		39.89	■■■■□ 3.98
MCM2-208	ENST00000480910	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		39.89	■■■■□ 3.98
MCM2-208	ENST00000480910	ARHGEF11	O15085	1522 aa		39.88	■■■■□ 3.97
MCM2-208	ENST00000480910	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.84	■■■■□ 3.97
MCM2-208	ENST00000480910	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.83	■■■■□ 3.97
MCM2-208	ENST00000480910	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.82	■■■■□ 3.97
MCM2-208	ENST00000480910	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.79	■■■■□ 3.96
MCM2-208	ENST00000480910	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.76	■■■■□ 3.96
MCM2-208	ENST00000480910	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.68	■■■■□ 3.94
MCM2-208	ENST00000480910	IGF1R	P08069	1367 aa		39.66	■■■■□ 3.94
MCM2-208	ENST00000480910	NUP160	Q12769	1436 aa		39.63	■■■■□ 3.93
MCM2-208	ENST00000480910	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.61	■■■■□ 3.93
MCM2-208	ENST00000480910	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.59	■■■■□ 3.93
MCM2-208	ENST00000480910	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.58	■■■■□ 3.93
MCM2-208	ENST00000480910	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.38	■■■■□ 3.89
MCM2-208	ENST00000480910	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		39.37	■■■■□ 3.89
MCM2-208	ENST00000480910	CUL7	Q14999	1698 aa		39.36	■■■■□ 3.89
MCM2-208	ENST00000480910	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.33	■■■■□ 3.89
MCM2-208	ENST00000480910	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.29	■■■■□ 3.88

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.5 ms