Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SATB1Q01826 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SATB1Q01826 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms