Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAP1Q01518 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAP1Q01518 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CAP1Q01518 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAP1Q01518 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms