Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RACK1P63244 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RACK1P63244 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RACK1P63244 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RACK1P63244 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RACK1P63244 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RACK1P63244 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RACK1P63244 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RACK1P63244 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RACK1P63244 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RACK1P63244 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RACK1P63244 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RACK1P63244 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RACK1P63244 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RACK1P63244 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RACK1P63244 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RACK1P63244 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RACK1P63244 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RACK1P63244 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RACK1P63244 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RACK1P63244 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RACK1P63244 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RACK1P63244 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RACK1P63244 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RACK1P63244 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RACK1P63244 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RACK1P63244 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RACK1P63244 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RACK1P63244 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RACK1P63244 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RACK1P63244 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RACK1P63244 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RACK1P63244 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RACK1P63244 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RACK1P63244 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RACK1P63244 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RACK1P63244 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RACK1P63244 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RACK1P63244 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RACK1P63244 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RACK1P63244 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RACK1P63244 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RACK1P63244 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RACK1P63244 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RACK1P63244 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RACK1P63244 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RACK1P63244 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RACK1P63244 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RACK1P63244 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RACK1P63244 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RACK1P63244 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RACK1P63244 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RACK1P63244 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RACK1P63244 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RACK1P63244 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RACK1P63244 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RACK1P63244 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RACK1P63244 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RACK1P63244 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RACK1P63244 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RACK1P63244 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RACK1P63244 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RACK1P63244 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RACK1P63244 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RACK1P63244 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RACK1P63244 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RACK1P63244 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RACK1P63244 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RACK1P63244 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RACK1P63244 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RACK1P63244 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RACK1P63244 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RACK1P63244 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RACK1P63244 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RACK1P63244 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RACK1P63244 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RACK1P63244 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RACK1P63244 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RACK1P63244 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RACK1P63244 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RACK1P63244 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RACK1P63244 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RACK1P63244 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RACK1P63244 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RACK1P63244 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RACK1P63244 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RACK1P63244 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RACK1P63244 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RACK1P63244 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RACK1P63244 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RACK1P63244 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RACK1P63244 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RACK1P63244 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RACK1P63244 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RACK1P63244 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RACK1P63244 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RACK1P63244 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RACK1P63244 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RACK1P63244 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RACK1P63244 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms