Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCDC1P59894 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCDC1P59894 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCDC1P59894 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms