Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4BP51164 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4BP51164 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4BP51164 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP4BP51164 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP4BP51164 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4BP51164 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4BP51164 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4BP51164 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4BP51164 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4BP51164 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4BP51164 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms