Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC11A1P49279 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC11A1P49279 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC11A1P49279 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms