Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIP4K2AP48426 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIP4K2AP48426 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIP4K2AP48426 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIP4K2AP48426 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIP4K2AP48426 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIP4K2AP48426 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PIP4K2AP48426 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PIP4K2AP48426 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PIP4K2AP48426 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PIP4K2AP48426 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms