Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPTX2P47972 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPTX2P47972 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPTX2P47972 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPTX2P47972 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPTX2P47972 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NPTX2P47972 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms