Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A1P43005 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms