Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC1A3P43003 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms