Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPAP38571 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPAP38571 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPAP38571 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPAP38571 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPAP38571 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPAP38571 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPAP38571 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPAP38571 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPAP38571 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPAP38571 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPAP38571 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPAP38571 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPAP38571 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPAP38571 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPAP38571 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPAP38571 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPAP38571 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPAP38571 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPAP38571 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPAP38571 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPAP38571 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPAP38571 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPAP38571 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPAP38571 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPAP38571 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPAP38571 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPAP38571 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPAP38571 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPAP38571 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPAP38571 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPAP38571 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPAP38571 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPAP38571 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPAP38571 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPAP38571 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPAP38571 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LIPAP38571 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIPAP38571 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPAP38571 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPAP38571 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPAP38571 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPAP38571 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPAP38571 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPAP38571 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPAP38571 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPAP38571 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIPAP38571 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPAP38571 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPAP38571 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPAP38571 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPAP38571 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPAP38571 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPAP38571 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPAP38571 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPAP38571 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPAP38571 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPAP38571 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIPAP38571 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIPAP38571 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms