Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GGCXP38435 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGCXP38435 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGCXP38435 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGCXP38435 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGCXP38435 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GGCXP38435 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGCXP38435 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGCXP38435 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGCXP38435 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GGCXP38435 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGCXP38435 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGCXP38435 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGCXP38435 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGCXP38435 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGCXP38435 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGCXP38435 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGCXP38435 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGCXP38435 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGCXP38435 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGCXP38435 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGCXP38435 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGCXP38435 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGCXP38435 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGCXP38435 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GGCXP38435 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGCXP38435 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGCXP38435 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGCXP38435 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGCXP38435 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGCXP38435 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGCXP38435 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGCXP38435 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGCXP38435 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGCXP38435 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGCXP38435 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGCXP38435 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GGCXP38435 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGCXP38435 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGCXP38435 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGCXP38435 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGCXP38435 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGCXP38435 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGCXP38435 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGCXP38435 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGCXP38435 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGCXP38435 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGCXP38435 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGCXP38435 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGCXP38435 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGCXP38435 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGCXP38435 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GGCXP38435 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGCXP38435 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGCXP38435 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGCXP38435 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGCXP38435 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGCXP38435 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGCXP38435 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGCXP38435 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGCXP38435 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGCXP38435 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGCXP38435 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGCXP38435 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGCXP38435 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGCXP38435 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGCXP38435 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGCXP38435 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGCXP38435 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GGCXP38435 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GGCXP38435 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GGCXP38435 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GGCXP38435 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGCXP38435 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGCXP38435 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGCXP38435 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGCXP38435 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGCXP38435 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGCXP38435 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGCXP38435 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGCXP38435 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGCXP38435 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGCXP38435 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGCXP38435 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGCXP38435 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGCXP38435 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGCXP38435 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGCXP38435 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGCXP38435 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGCXP38435 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGCXP38435 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGCXP38435 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGCXP38435 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGCXP38435 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GGCXP38435 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGCXP38435 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGCXP38435 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGCXP38435 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGCXP38435 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GGCXP38435 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms