Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX6P35712 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX6P35712 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX6P35712 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX6P35712 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX6P35712 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX6P35712 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX6P35712 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX6P35712 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX6P35712 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX6P35712 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX6P35712 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX6P35712 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX6P35712 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX6P35712 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX6P35712 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX6P35712 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX6P35712 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX6P35712 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX6P35712 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX6P35712 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX6P35712 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX6P35712 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX6P35712 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX6P35712 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX6P35712 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX6P35712 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX6P35712 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX6P35712 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX6P35712 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX6P35712 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX6P35712 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX6P35712 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX6P35712 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX6P35712 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOX6P35712 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX6P35712 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX6P35712 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX6P35712 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX6P35712 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX6P35712 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX6P35712 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOX6P35712 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX6P35712 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX6P35712 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX6P35712 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX6P35712 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX6P35712 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX6P35712 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX6P35712 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX6P35712 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX6P35712 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX6P35712 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX6P35712 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX6P35712 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX6P35712 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX6P35712 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX6P35712 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX6P35712 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX6P35712 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX6P35712 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX6P35712 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX6P35712 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX6P35712 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX6P35712 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX6P35712 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX6P35712 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX6P35712 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX6P35712 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX6P35712 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX6P35712 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX6P35712 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX6P35712 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX6P35712 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX6P35712 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms