Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA4P35212 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA4P35212 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA4P35212 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA4P35212 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA4P35212 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA4P35212 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA4P35212 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA4P35212 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA4P35212 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA4P35212 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA4P35212 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA4P35212 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA4P35212 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA4P35212 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA4P35212 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA4P35212 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA4P35212 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA4P35212 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA4P35212 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA4P35212 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA4P35212 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA4P35212 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA4P35212 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA4P35212 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA4P35212 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA4P35212 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA4P35212 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA4P35212 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA4P35212 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA4P35212 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA4P35212 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA4P35212 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA4P35212 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJA4P35212 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA4P35212 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA4P35212 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA4P35212 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA4P35212 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA4P35212 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA4P35212 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA4P35212 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA4P35212 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA4P35212 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA4P35212 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA4P35212 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA4P35212 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA4P35212 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA4P35212 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA4P35212 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA4P35212 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA4P35212 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA4P35212 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA4P35212 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA4P35212 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA4P35212 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA4P35212 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA4P35212 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA4P35212 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA4P35212 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA4P35212 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA4P35212 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA4P35212 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA4P35212 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA4P35212 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA4P35212 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA4P35212 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA4P35212 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA4P35212 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA4P35212 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA4P35212 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA4P35212 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA4P35212 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA4P35212 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA4P35212 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA4P35212 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA4P35212 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA4P35212 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA4P35212 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA4P35212 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA4P35212 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA4P35212 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA4P35212 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA4P35212 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA4P35212 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA4P35212 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA4P35212 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA4P35212 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA4P35212 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA4P35212 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA4P35212 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA4P35212 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA4P35212 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA4P35212 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA4P35212 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA4P35212 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA4P35212 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA4P35212 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA4P35212 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA4P35212 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms