Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DSG3P32926 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DSG3P32926 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
DSG3P32926 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DSG3P32926 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DSG3P32926 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DSG3P32926 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DSG3P32926 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DSG3P32926 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
DSG3P32926 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DSG3P32926 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DSG3P32926 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DSG3P32926 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DSG3P32926 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DSG3P32926 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DSG3P32926 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DSG3P32926 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DSG3P32926 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DSG3P32926 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DSG3P32926 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DSG3P32926 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DSG3P32926 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DSG3P32926 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DSG3P32926 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DSG3P32926 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DSG3P32926 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DSG3P32926 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DSG3P32926 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DSG3P32926 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DSG3P32926 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DSG3P32926 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DSG3P32926 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DSG3P32926 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSG3P32926 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSG3P32926 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSG3P32926 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DSG3P32926 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSG3P32926 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSG3P32926 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSG3P32926 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSG3P32926 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSG3P32926 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSG3P32926 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSG3P32926 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSG3P32926 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DSG3P32926 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSG3P32926 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DSG3P32926 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSG3P32926 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG3P32926 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG3P32926 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG3P32926 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG3P32926 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG3P32926 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG3P32926 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG3P32926 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG3P32926 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG3P32926 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSG3P32926 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSG3P32926 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSG3P32926 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSG3P32926 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSG3P32926 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSG3P32926 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSG3P32926 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSG3P32926 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSG3P32926 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG3P32926 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG3P32926 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG3P32926 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG3P32926 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG3P32926 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG3P32926 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG3P32926 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG3P32926 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG3P32926 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG3P32926 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSG3P32926 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSG3P32926 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSG3P32926 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSG3P32926 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSG3P32926 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSG3P32926 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSG3P32926 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSG3P32926 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSG3P32926 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSG3P32926 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSG3P32926 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSG3P32926 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSG3P32926 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DSG3P32926 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSG3P32926 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG3P32926 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG3P32926 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG3P32926 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG3P32926 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSG3P32926 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSG3P32926 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSG3P32926 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSG3P32926 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms