Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM2P31350 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM2P31350 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM2P31350 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM2P31350 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM2P31350 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM2P31350 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM2P31350 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM2P31350 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRM2P31350 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRM2P31350 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM2P31350 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM2P31350 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM2P31350 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM2P31350 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRM2P31350 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM2P31350 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM2P31350 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM2P31350 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM2P31350 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM2P31350 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM2P31350 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM2P31350 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRM2P31350 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRM2P31350 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRM2P31350 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRM2P31350 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRM2P31350 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRM2P31350 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRM2P31350 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRM2P31350 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRM2P31350 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRM2P31350 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRM2P31350 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRM2P31350 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRM2P31350 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRM2P31350 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRM2P31350 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRM2P31350 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRM2P31350 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRM2P31350 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRM2P31350 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRM2P31350 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRM2P31350 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRM2P31350 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRM2P31350 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRM2P31350 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRM2P31350 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRM2P31350 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRM2P31350 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRM2P31350 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRM2P31350 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRM2P31350 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RRM2P31350 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRM2P31350 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRM2P31350 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RRM2P31350 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRM2P31350 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRM2P31350 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRM2P31350 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRM2P31350 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRM2P31350 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRM2P31350 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRM2P31350 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRM2P31350 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRM2P31350 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRM2P31350 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRM2P31350 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRM2P31350 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRM2P31350 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRM2P31350 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRM2P31350 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRM2P31350 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRM2P31350 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RRM2P31350 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRM2P31350 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRM2P31350 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRM2P31350 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRM2P31350 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRM2P31350 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRM2P31350 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRM2P31350 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRM2P31350 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRM2P31350 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRM2P31350 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRM2P31350 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RRM2P31350 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRM2P31350 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRM2P31350 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRM2P31350 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRM2P31350 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRM2P31350 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRM2P31350 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRM2P31350 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRM2P31350 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRM2P31350 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRM2P31350 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRM2P31350 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRM2P31350 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRM2P31350 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms