Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH3P22223 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH3P22223 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH3P22223 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH3P22223 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH3P22223 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH3P22223 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH3P22223 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH3P22223 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH3P22223 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH3P22223 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH3P22223 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH3P22223 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH3P22223 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH3P22223 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH3P22223 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH3P22223 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH3P22223 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH3P22223 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH3P22223 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH3P22223 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH3P22223 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH3P22223 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH3P22223 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH3P22223 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH3P22223 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH3P22223 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH3P22223 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH3P22223 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH3P22223 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH3P22223 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH3P22223 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH3P22223 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH3P22223 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH3P22223 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH3P22223 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH3P22223 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH3P22223 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH3P22223 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH3P22223 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH3P22223 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH3P22223 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH3P22223 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH3P22223 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH3P22223 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH3P22223 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH3P22223 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH3P22223 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH3P22223 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH3P22223 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH3P22223 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH3P22223 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH3P22223 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH3P22223 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH3P22223 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH3P22223 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH3P22223 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH3P22223 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH3P22223 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH3P22223 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH3P22223 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH3P22223 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH3P22223 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH3P22223 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH3P22223 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH3P22223 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH3P22223 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH3P22223 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH3P22223 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH3P22223 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH3P22223 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH3P22223 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH3P22223 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDH3P22223 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH3P22223 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH3P22223 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH3P22223 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH3P22223 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH3P22223 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH3P22223 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH3P22223 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH3P22223 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH3P22223 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH3P22223 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH3P22223 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH3P22223 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH3P22223 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH3P22223 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH3P22223 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH3P22223 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH3P22223 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH3P22223 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH3P22223 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH3P22223 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH3P22223 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH3P22223 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH3P22223 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH3P22223 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH3P22223 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH3P22223 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms