Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2EP19388 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2EP19388 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms